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對於論文風波,郭明良坦承,他督導有缺失,向台大請辭也是為了承擔督導不周的責任,但實驗室團隊共產生一一七篇論文,其中僅有兩篇論文因違反學術倫理被撤回,這是單一個案,並非外傳的實驗室集體造假,不應該污衊其他學生的努力,也拒絕此汙名扣在實驗室頭上。郭明良在記者會一開始就二度鞠躬道歉,並表示對於論文事件造成社會資源浪費,對學術界造成很大衝擊,他向學術界和社會大眾道歉,但事件發生後他並沒有神隱,一直都在積極處理和準備資料。
郭明良指出,團隊成員在十月二十日發現博士後研究員查詩婷在二○一六年八月十五日發表的論文有瑕疵,他主動聯絡查詩婷,但查詩婷僅表示標示不清,他就主動去信該期刊堪誤,後來國外匿名網站在十一月二日再度質疑該篇論文,他也再次詢問查詩婷,但查詩婷依然否認,因此他於十一月四日再次去函詢問論文>2016台東年菜推薦處理進度。
郭明良表示,因為對查詩婷的說法有疑慮,他決定再次調查,但查詩婷支吾其詞,因此他不再相信,主動去信期刊撤回論文並呈報校方,而查詩婷也在十一月九日主動請辭,他在十一月十日將查詩婷的自白書呈交校方,當天媒體就報導此消息,由於他監督不周,所以在十一月十一日口頭向校方請辭,十一月十八日配合校方發聲明稿後就靜候調查。
被質疑論文造假的台大教授郭明良今天首度現身,為論文風波造成衝擊鞠躬道歉,他強調未參與造假,更非集體造假,也駁斥買賣論文,盼外界不要未審先判。
至於他和嚴孟祿的金錢來往,郭明良表示,兩人是高中同學,也是好朋友、好兄弟,自己的個人環境較困苦,在台大升等教授後買房,但因為高利息而壓力很大,經濟較寬裕的嚴孟祿得知後,主動無息貸款給他,也未要求何時前一定要還清,雙方也留下清楚的支票或匯款紀錄,但這些往返的票據紀錄,被有心人士侵入電腦,將資料散播到媒體,並用不當連結指稱兩人買賣論文。
郭明良表示,兩人共同掛名的論文只有八篇,其中只有兩篇他是通訊作者,但嚴孟祿並未用這兩篇論文升等,怎會有對價關係,對於外界指控,他嚴厲駁斥。
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